该节目第二季是一档新型益智类推理轻综艺节目，每期由工藤思钧（齐思钧）、蒲尔摩斯（蒲熠星）、马雪（马剑越）、石仁（石凯）和“黑马侦探”（飞行嘉宾）组成“时空侦探团”穿梭于各个时空破解谜案，主要围绕十二个情节跌宕起伏的主题故事，通过“是”与“不是”的回答来推理每个故事的真相，达到十分钟极速推理使真相无处遁形。

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野田伍郎（藤原龙也 饰）少年时父母因债台高筑双双自杀，自此伍郎生活陷于黑暗，辗转于孤儿院、少管所、黑帮等边缘地带。回到日本后，他与当年的好友公介（塩谷瞬 饰）、纯、达男合伙靠婚姻欺诈为生。 某日，他们在宾馆地下车库拍到绑架镜头，继而从电视上得知，被绑架者是一起政治舞弊案的重要证人。参与绑架者隶属于一个名为RCA（危机处理代理机构）的神秘组织，其成员皆为身怀绝技的格斗高手，专门负责替政要处理棘手问题。伍郎意识到其中的危险，与RCA达成协议，保证不泄露当天细节。而公介却因急需用钱，私下将录像透露给电视台。此举惹怒RCA和幕后政要，伍郎等人成为被狙杀的对象……

唐山武馆馆主庄三太在武林比武中胜出，获得武林至尊匾，此时，百胜道场钟鉴均（任世官 饰）登门挑战。因忠、庄二人在十八年前为争夺钟夫人结下冤仇，钟鉴均痛下杀手，用绝技三弹腿将庄三太重伤致死。庄三太高徒唐浩云（成龙 饰）与师母和师妹（苗可秀 饰）自此浪迹天涯，矢志复仇。而钟夫人因丈夫下手毒辣，以死相劝，钟鉴均痛惜爱妻之死，将“百胜”改为“百忍”。三年之后，百忍道场深得村民信任，临近的豪门魏家横行乡里，百忍道场受村民所托捉拿魏家的恶仆，恰在此时，武功精进的唐浩云赶赴百忍道场寻仇，一心赎罪的钟鉴均无意反抗，唐浩云只得罢手，而魏家此时却设计圈套，要借唐浩云之手杀害钟鉴均……

千年前，残暴的西摩族以天外陨石打造出水晶棺，妄图利用其神秘力量扩大权势，岂料门内叛变，引爆水晶棺的神秘力量，古国一夜间被夷为平地……民国年间，金盆洗手的摸金校尉后人丁彦昌为救同伴性命，被迫与债主黄海山等人踏上冒险之旅，寻找西摩族地宫遗址。众人深入天坑遭遇未知生物的袭击，丁彦昌与同伴逃亡中误穿时空节点，偶遇神秘女人温朵娜，被带领来到千年前消失的古城。阴谋与诡异生物相继来袭，重重危机中，丁彦昌和温朵娜互生情愫，与同伴深入虎穴，挫败西摩族后裔的千年阴谋，拯救了苍生。最终两人不得不分离，丁彦昌离开异时空，与同伴回到现实世界。

王启明（古天乐饰）是一个银行经理，毫无浪漫细胞的他竟然在情人节带着女友Annie（梁咏琪饰）排长队吃火锅，令女友十分生气，感情进入冰冻期。

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讲述了暗影魔城之主摩璎为控制唐三藏夺取永恒之火，使用魔城能满足一切欲望的能力引出唐三藏心魔。最终，唐三藏克服心魔，重新觉醒，他与徒弟们联手打败摩璎，瓦解了祸害一方的魔城，重新踏上了拯救天下苍生的旅途。

郭炎和薛天因一出闹剧意外被教练雷明看中，被“忽悠”加入明承大神秘社团—拔河队，和其他六个毫无运动基础的队员从一盘散沙到聚沙成塔，勇猛冲刺全国赛，开启一场青春的逆袭之路。

讲述了1950年前后，在上海新中国第一代公安战士与蒋介石特务企图颠覆新中国而斗争的故事，故事围绕一位拥有高智商但在旧社会并不得志、在新中国得到自新并成长的旧时期小警察与一位经验丰富的中共老特工联手搭档展开。

以戏说的角度，讲述了康熙年间，由于长年黄河泛滥，康熙帝（张国立 饰）为了体恤民情，亲自下江南考察，由此引出了一出出颇为传奇的故事。第一部由《犁头记》、《铜鼎记》、《八宝粥记》、《紫砂记》这四个故事构成。

1999年，由于数码世界资料异常增生，导致数码世界和现实世界的连接发生紊乱。地球上相应地出现奇怪的自然现象：东南亚没有下雨，池塘全部干涸；中东却因为连场大雨发生洪水；美国则遇到有史以来最寒冷的冬天。